Datteren hans sier søndag at hun frykter for farens sikkerhet.
Professor Faizullah Jalal ble arrestert av Taliban lørdag etter å ha åpent kritisert regimet flere ganger.
En talsperson for regjeringen skriver på Twitter at Jalal har kommet med uttalelser i sosiale medier der han har «forsøkt å vende folk mot myndighetene».
«Han er arrestert slik at ikke andre skal komme med lignende meningsløse kommentarer … som skader andres verdighet», la han til.
Professorens datter, Hasina Jalal, som er stipendiat ved universitetet Georgetown i Washington, hevder på sin side at enkelte av farens uttalelser stammer fra en falsk Twitter-konto.
– Taliban bruker bare disse innleggene som en unnskyldning for å tie en sterk stemme i landet, sier Hasina til AFP. Hun forteller at familien hennes ikke har hatt kontakt med faren, som blir holdt på et ukjent sted.
– Vi er veldig bekymret for hans helse og sikkerhet, la hun til.